《校园怪灵》第三季延续了前两季的悬疑奇幻风格，将校园传说与现实谜团交织，构建出更复杂的超自然世界观。本季以“记忆回溯”为核心线索，讲述主角团为揭开校园地下封印的真相，被迫穿梭于不同时空碎片，对抗因怨念而实体化的历史亡灵。剧情开篇从第二季结尾的“钟楼爆炸事件”切入，揭示爆炸实为古老结界破裂的征兆，导致近百年的怨灵集体苏醒。随着调查深入，主角们发现学校原址曾是民国时期的灵异研究所，所有怪谈均与一场失败的“灵魂净化实验”有关。
人物关系网在本季得到史诗级扩展。女主角林晓雨在继承祖母的通灵能力后，首次直面家族诅咒——她的血脉实为封印怨灵的关键“锁钥”。新角色历史教师陈墨登场，表面是协助调查的顾问，实为当年实验幸存者的后代，其随身怀表能暂停灵体时间。而原学生会会长陆子轩在本季黑化，因妹妹被怨灵附身而选择与反派组织“夜鸦”合作，形成亦正亦邪的三角对峙。特别值得关注的是幽灵少女小婉的支线，她破碎的记忆拼图逐渐揭示出实验真相：所有怨灵皆是被剥离情感的人类灵魂。
第三季在叙事结构上采用双线并行。现实线中，主角团需在月食周期前收集散落的“净念水晶”；回忆线则通过怨灵的视角，重现1943年实验事故的完整经过。第9集“血色毕业照”堪称封神之作，通过一张不断变化的集体照，将六个时代的受害者命运串联，其中1958届学姐苏婉的轮回悲剧，让“校园七大不可思议”传说得到闭环解释。最终决战在百年校庆夜展开，当林晓雨选择以自身为容器吸收所有怨灵时，陈墨突然逆转怀表指针，暴露出他才是初代实验体的惊人真相。
本季在恐怖氛围营造上更注重心理压迫感。如图书馆的“无限书架”空间，通过视觉错位让人产生认知紊乱；生物教室的标本复活事件，则探讨了生命伦理的边界。而真正令人脊背发凉的是第12集的“镜像世界”设定，当角色们发现所有灵异现象都是现实世界的倒影投射时，剧集提出了贯穿全季的核心诘问：究竟是人类创造了怪谈，还是怪谈塑造了人类的恐惧？这些设计使《校园怪灵》第三季超越了普通灵异剧，成为兼具哲学思辨与社会隐喻的深度作品。