《TOKYOMER移动的急救室南海任务》剧场版延续了电视剧系列的高强度医疗救援主题，将舞台从东京都市圈拓展至危机四伏的南海孤岛。本片讲述了急救专家团队“TOKYOMER”受邀前往南海某岛屿，参与一场国际联合医疗救援演习，却意外遭遇真实重大灾难的故事。演习过程中，岛屿突发特大地震并引发海啸，导致当地居民、演习人员及外国使团被困。团队必须在通信中断、资源匮乏的极端环境下，利用移动急救室的先进设备与医疗智慧，展开一场与时间赛跑的生死救援。
剧情主线围绕急救中心主任赤冢梓（主演：铃木亮平）带领的团队展开。赤冢不仅需要协调国际救援队伍的矛盾，还要应对岛屿内部因地质灾难引发的次生危机，如火山气体泄漏与疫情风险。影片通过多线叙事，呈现了灾难中不同群体的挣扎：包括当地坚持传统生活方式的老人、外国科研团队背后的政治博弈，以及TOKYOMER成员自身的心理创伤。高潮部分，团队发现岛屿深处隐藏着未公开的生化实验室，救援行动升级为防止全球性卫生危机的战斗。
人物关系方面，赤冢梓与团队核心成员——冷静的外科医生雪村白夜（演员：贺来贤人）和擅长危机管理的护士长羽田光（演员：中条彩未）——形成了坚实的“救援铁三角”。本片新增了国际医疗组织代表艾玛·克劳斯（特邀演员：跨国出演），她与赤冢在理念上的冲突与合作，体现了全球化救援中的文化碰撞。此外，赤冢与岛上老医生森田（演员：国村隼）的互动，揭示了传统医学与现代急救技术的融合。而团队成员各自的过往故事也在救援过程中逐渐浮现，如羽田光因曾经历地震灾难而对海啸产生心理阴影，这些情感线索加深了角色的立体性。
影片通过紧凑的救援场景与人性刻画，探讨了医疗伦理、国际合作与生命尊严的主题。最终，团队在有限资源下成功化解危机，但代价是一名成员的牺牲，这一结局引发观众对救援者使命的深刻反思。剧场版在特效与节奏上全面升级，海上直升机救援、地下实验室爆破等大场面，强化了作品的视觉冲击力，而细腻的人物对话则保持了系列一贯的人文关怀。